合成生物学本年度最高峰会,欧洲合成生物学会议将于2019年5月5-9日在丹麦召开。本次会议将围绕发现新天然产物的最新进展,阐明其生物合成途径,潜在途径的激活或异源宿主中途径的表达,以及产量的提高。在整个会议期间,将举例说明新天然产品如何能够作为抗生素,抗癌药物,镇痛药或其他药物实现临床应用。
合成生物学是本世纪初在基因组学和系统生物学全面发展的基础上,以工程科学理念引入生命科学研究领域为特征而形成的新兴前沿交叉学科。合成生物学研究具两个基本属性:一是生命本质的认识提升属性,它使人类能够以“上帝视角”去系统认知生物体的“智商”;二是生物制造属性,通过人造细胞工厂实现高效生产。随着生命科学的发展,合成生物学已经使人们从“读取”遗传信息的基因测序时代迈入到“书写”新的生命体的阶段,真正实现了设计。合成生物学近年来掀起的技术革命已经彻底颠覆了人们过去对于生命科学和生物技术的认知。
会议邀请了诺贝尔化学奖得主AdaYonath教授(因“对核糖体结构和功能的研究”而分享了2009年诺贝尔化学奖)等一批著名科学家作主旨报告。值得一提的是,华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室主任张立新教授,为此次会议邀请的报告人中唯一来自中国的科学家。生物反应器工程国家重点实验室1989年获准立项,1995年底通过国家验收,1996年正式对外开放,在上一轮国重室评估中获得优秀。
希望通过这次会议,实现国际合成生物学研究与重点实验室相互交流建设经验,并在合成生物学领域初步形成了交叉合作,推动今后的联合创新,促进原创性科研成果产出。
合成生物学是本世纪初在基因组学和系统生物学全面发展的基础上,以工程科学理念引入生命科学研究领域为特征而形成的新兴前沿交叉学科。合成生物学研究具两个基本属性:一是生命本质的认识提升属性,它使人类能够以“上帝视角”去系统认知生物体的“智商”;二是生物制造属性,通过人造细胞工厂实现高效生产。随着生命科学的发展,合成生物学已经使人们从 “读取”遗传信息的基因测序时代迈入到“书写”新的生命体的阶段,真正实现了设计。合成生物学近年来掀起的技术革命已经彻底颠覆了人们过去对于生命科学和生物技术的认知。
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我们先来看一下这次欧洲合成生物学大会的大概情况:
会议主办方
Novo Nordisk Foundation together with NNF Center for Biosustainability
会议主题
Synthetic biology
Chemical biology
Pathway reconstruction
Enzyme discovery
Genome mining
Cell factory design
Plant natural products
Natural products from fungi andactinomycetes
Marine natural products
会议讲者
Ada Yonath,Weizmann Instituteof Science
Anne Osbourn,John Innes Centre
Ben Shen,Scripps Research
Birger Lindberg Møller,Universityof Copenhagen
Christian Hertweck,Hans KnöllInstitute
Christina Smolke,StanfordUniversity
David Sherman,University ofMichigan
Elke Dittman,Potsdam University
Elizabeth Sattely,StanfordUniversity
Emily Balskus,Harvard University
Eva Sonnenschein,TechnicalUniveristy of Denmark
Evi Stegmann,University of Tübingen
Fernando de la Calle,PharmaMar
Heike Brötz-Oesterhelt,Universityof Tübingen
Jay Keasling,Univesity ofCalifornia, Berkeley
Kirsten Benjamin,Amyris
Lena Gerwick,Scripps Institutionon Oceanography
Lixin Zhang,East ChinaUniversity of Science and Technology
Lone Gram,Technical Univeristyof Denmark
Marnix Medema,WageningenUniversity
Nadine Ziemert,Universityof Tübingen
Nancy Keller,University ofWisconsin-Madison
Paul Jensen,Scripps Institutionon Oceanography
Peter Leadlay,University of Cambridge
Rebecca Goss,University of St.Andrews
Sang Yup Lee,Korea AdvancedInstitute of Science and Technology
Sarah O’Connor,John InnesCentre
Tanja Gulder,Technical Universityof Munich
Tanja Schneider,Universityof Bonn
Tilmann Weber,Technical Univeristyof Denmark
Tobias Gulder,Technical Universityof Munich
Tang Yi,University ofCalifornia Los Angeles
Yudai Matsuda,University of HongKon
2009年,Ada Yonath与Thomas Steitz和Vendatraman Ramakrishnan三位教授因在核糖体晶体结构解析方面作出的重大贡献荣获诺贝尔化学奖。莫愁要特别指出的是,Ada Yonath是为数不多的诺贝尔化学奖女性得主。
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作为21世纪生物学领域新兴的一门学科,合成生物学是分子和细胞生物学、进化系统学、生物化学、信息学、数学、计算机和工程学等多学科交叉的产物。2014年,美国国防部将其列为21世纪优先发展的六大颠覆性技术之一;英国商业创新技能部将其列为未来的八大技术之一;我国在2014年完成的第三次技术预测中,将之列为十大重大突破类技术之一,在“十三五”科技创新战略规划中,将其列为了战略性前瞻性重点发展方向。
近几年,合成生物学的设计能力不断增加,不仅仅是在复杂的基因电路方面,在基因组层面,也有了长足的进步和鼓舞人心的进展,如Craig Venter的Synthia 3.0,酵母基因组计划Sc2.0,人类基因组合成计划—HGP Write;合成生物学的应用也在不断的增加,基因编辑,天然产物,癌症疗法,器官移植......
合成生物学开发新疗法
一种由基因改造细菌制成的“活体药”在一项里程碑式的试验中,延长了患有严重代谢性疾病动物的寿命。
由麻省理工学院联合创办的Synlogic公司完成的一项研究近日发表在《Science Translational Medicine》上,由于高水平氨对于肝损伤和罕见遗传疾病患者来说是致命的,研究人员通过制造一种常见细菌菌株来清除体内多余的氨,从而创造了这种药物。
测试结果表明,这些微生物降低了氨的危险水平,易感小鼠的存活率提高了。一项对健康人群进行的小规模试验表明该细菌可以如预期那样工作,并且是安全的。
研究第一作者Caroline Kurtz说:“这些细菌经过改造后,它们在胃肠道中的作用可以被我们所控制。它也让我们考虑到很多其他疾病,治疗这些疾病时,我们需要为患者生产有益物质,或移除某些有毒物质。”
研究人员关注于一种名为高氨血症的疾病。当该疾病发生时,血液中的毒性的氨会积聚并影响大脑。病症轻微的患者会感觉恶心、没有胃口,兴奋不起来,但是在严重的情况下,它会导致不可逆转且致命的脑损伤。大部分接受治疗的高氨血症都有肝脏损伤,使肝脏无法将血液中的氨转化为尿液。高氨血症也会影响患有罕见遗传疾病的人。这些疾病会破坏肝脏处理氨的能力,大约一半在体内循环的氨被认为来自肠道细菌。
在该研究中,研究人员利用大肠杆菌nissle设计了他们的活体药物。一个多世纪以来,人类一直把nissle作为益生菌。在肠道中,它将氨转化为精氨酸,这是一种能降低血压的氨基酸。
研究人员调整了这种细菌的基因,使它们到达肠道中的低氧环境时会消耗比平时更多的氨。进一步的基因修改确保该细菌无法繁殖且无法定植于肠道。
然后,研究人员将这些修改过的细菌植入处理氨能力受损的小鼠体内。这些微生物使小鼠体内氨水平降低了一半并提升其存活率。所有未接受治疗的小鼠都在一周内死亡,而植入这些基因修饰细菌的小鼠在10天之后仍然存活。
为了测试该疗法对人体的安全性,有52名健康志愿者参与了第一阶段试验,他们被植入这些细菌。研究人员没发现严重的副作用,微生物也表现出预期的行为。当细菌将氨转化为精氨酸时,这些氨基酸被分解成硝酸盐,然后迅速地从尿液中排出。测试结果表明,接受最高剂量细菌志愿者尿液中的硝酸盐水平最高,这意味着更多的氨被清除。
Synlogic公司的总裁Aoife Brennan说,如果停止治疗,这些细菌会在两周内从体内清除,这表明该细菌不会永久定植在肠道中。
研究人员还必须考虑的另一个问题是,肠道中的其他微生物是否会获得这些基因修饰细菌的新基因。因为细菌对于与谁共享基因并不是特别挑剔,它们通常会通过称为水平基因转移的过程交换DNA。
根据研究人员的说法,该药物中使用的大肠杆菌菌株不会与其他细菌偶联。但是如果一些被修改的基因进入其他细菌,那这些细菌也不会拥有使它们能够胡作非为的优势。Brennan说:“我们设计的这种细菌不太可能进行任何转移。”
帝国理工学院英国合成生物学创新与知识中心的联合主任Paul Freemont说:“仅仅在几年前,在益生菌疗法中利用工程化肠道细菌还只是一个幻想,但现在我们开始看到利用合生生物学技术开发出全新疗法的希望,对肠道细菌进行改造,使其能够将高水平的氨转化为无害的精氨酸,这真是惊人的!
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