1、根据多糖多酚含量选择试剂盒
植物组织中或多或少含有多糖多酚。其中,多糖含量差异对后续PCR反应的影响较小,而多酚含量差异对PCR反应影响较大。
◆对于 多糖含量较高而多酚含量较低的材料,根据需要可以选用植物种子(或叶片)DirectPCR试剂盒,但选用多糖多酚类试剂盒,能够获得更好结果。
◆ 多酚含量高的材料对后续PCR反应影响较大,需要选用多糖多酚类试剂盒,才能够获得较好结果。
我公司已经对常见植物材料进行了多糖多酚测试 ,罗列如下:
A、低含量植物材料:油菜(叶片、种子)、水稻(叶片、种子)、小麦(叶片、种子)、玉米(叶片、种子)、大豆(叶片、种子)。
B、高含量植物材料:拟南芥(种子)、棉花(叶片、种子)、香蕉(叶片、果肉)、桔子(果皮)、马铃薯(块根)、洋葱(鳞叶)、苹果(果实)、芦荟(叶片)、西红柿(果实)。
如果您的样品不在上述已测试材料中,请按照以下方法进行多糖多酚测试:
取20mg左右组织块,或2片7mm直径左右的叶片,放入干净的1.5ml离心管中,加入200ul 200mM NaOH溶液,置于95℃ 10min。裂解完成后,观察其颜色变化,参照以下两种情况选择相应的试剂盒进行PCR实验。
A、如果裂解产物溶液呈绿色或淡黄色,说明该材料多酚含量较低,不影响PCR反应,可选用植物种子(叶片)DirectPCR试剂盒。
B、如果裂解产物溶液呈棕黄色或棕红色,说明该材料多酚含量较高,推荐使用多糖多酚类试剂盒。
2、根据种子体积大小选择试剂盒
在裂解阶段,考虑不同类型种子或组织材料在裂解过程中试剂用量的差异较大,为节约实验成本,用户可根据自己实验材料的大小选择相应的种子(中小型)DirectPCR试剂盒或种子(大型)DirectPCR试剂盒。
材料例举如下:
A、种子(中小型)DirectPCR试剂盒:1-30mg组织切块(边长1-5mm);1-10mg小型单粒种子(拟南芥、烟草、油菜);10-50mg中型单粒种子(小麦、水稻)。
B、种子(大型)DirectPCR试剂盒:>50mg单粒种子(棉花、玉米、大豆);100mg磨碎样本(直径0.5mm左右颗粒)。
3、根据实验是否需要防污染选择试剂盒
◆ 小量不同样本PCR实验,不需要防PCR产物污染的,可选择普通种子(叶片)DirectPCR试剂盒。
◆ 大量重复相同样本PCR实验,需要防PCR产物污染的,可选择防PCR污染DirectPCR试剂盒(UNG版本)。